2020-11-12, 11:23 AM
Bonjour,
J'ai une question concernant les métriques de distance.
Par exemple, si je veux utiliser UMAP sur mon jeu de données avec FlowJo, le plugin me propose 4 métriques : euclidean, manathan, cosine, hamming. Si j'ai bien compris, ces métriques correspondent à la façon dont vont être calculées les distances entre 2 points. Dans les publications je vois que c'est souvent la métrique euclidean qui est utilisée.
Mes questions sont les suivantes : Comment choisir la métrique que je dois utiliser sur mon jeu de données ? Y-a-t-il une métrique plus adaptée pour les jeux de données de cytométrie ?
Merci d'avance pour vos retours et votre aide
Anne-Laure
J'ai une question concernant les métriques de distance.
Par exemple, si je veux utiliser UMAP sur mon jeu de données avec FlowJo, le plugin me propose 4 métriques : euclidean, manathan, cosine, hamming. Si j'ai bien compris, ces métriques correspondent à la façon dont vont être calculées les distances entre 2 points. Dans les publications je vois que c'est souvent la métrique euclidean qui est utilisée.
Mes questions sont les suivantes : Comment choisir la métrique que je dois utiliser sur mon jeu de données ? Y-a-t-il une métrique plus adaptée pour les jeux de données de cytométrie ?
Merci d'avance pour vos retours et votre aide
Anne-Laure